MICROSCOPIA OTTICA E DIGITALIZZAZIONE (MICRODIG 2D/3D)

Il laboratorio di microscopia ottica e digitalizzazione (presso le sedi di Bologna, Lerici, Napoli, Trieste e Venezia) è equipaggiato di strumentazioni per l’osservazione, l’identificazione e l’acquisizione di immagini e video di materiale organico (organismi uni o pluricellulari viventi e fossili, fitoplancton e zooplancton) e inorganico (granuli, materiale vulcanoclastico, microplastiche e microfibre tessili, ecc…). L’osservazione e l’acquisizione dei dati possono essere effettuate sia su sezioni sottili che su campioni di varie matrici ambientali (acqua, sedimenti, organismi).

Tecniche e Metodologie

• Analisi tassonomiche e studio morfometrico di micro-macro alghe e invertebrati marini attraverso Microscopia ottica 2D/3D
• Catalogazione, digitalizzazione e metadatazione dei campioni e delle collezioni scientifiche di ISMAR relative a micro-macro invertebrati, campioni d’erbario e materiale ancillare
• Identificazione tassonomica, analisi quali-quantitative e di biomassa di micro invertebrati attuali e fossili quali Foraminiferi, Pteropodi, Fitoplancton e macroinvertebrati bentonici.
• Tefrostratigrafia e biostratigrafia su residui di lavaggio o sezioni sottili
• Preparazione materiale per analisi di geochimica isotopica ed ambientale (isotopi stabili, elementi in traccia, datazioni 14C) con valutazione dello stato di preservazione dei gusci.
• Analisi petrografiche di rocce sedimentarie ed ignee
• Analisi su campioni biologici di vertebrati e invertebrati di habitat marino-costieri per lo studio della biologia riproduttiva in ambito ambientale ed ecotossicologico (analisi computerizzata della motilità spermatica, morfologia gameti, capacità fecondante e di sviluppo larvale, analisi sezioni istologiche)
• Estrazione e analisi quali-quantitative di microplastiche e microfibre tessili estratte da varie matrici ambientale (acqua, sedimenti, organismi)

Strumentazione

• Stereomicroscopi binoculari (Zeiss SteREO Discovery.V8, Nikon SMZ1500, Leica MZ16) dotati di telecamere Axiocam e software (Zen Lite, NIS Elements BR) per acquisizione ed elaborazione immagini
• Stereomicroscopi a doppia postazione di lavoro Wild M3
• Microscopi ottici polarizzati, invertiti a contrasto di fase e a fluorescenza (e.g. Zeiss Axioscop POL e FLUO, Axioscop 40) equipaggiati con telecamera e sistema di analisi di immagine
• Microscopi invertiti a contrasto di fase e a fluorescenza (Zeiss Axiovert 35 e Axiovert S100) e stereomicroscopi binoculari (Zeiss Stemi 2000-CS) equipaggiati con telecamera e sistema di analisi di immagine
• Microscopi ottici Nikon Eclipse E600 con telecamera per analisi motilità spermatica Sperm Class Analyzer e UV supply
• Microscopi 3D digitali HR con telecamera per caratterizzazione ottica 2D/3D e morfometrica
• Microscopio µFT-IR con modalità riflessione, trasmissione e ATR con stage automatizzato in XYZ per mappature automatiche del campione e software acquisizione/elaborazione dati (Bruker LUMOS)
• Dell Mobile Precision Workstation 7670 + Monitor Coloredge CG2700X (27 inch, R: 164 ppi) con sensore di calibrazione integrato
• Digital planetary scanner Bookeye® 3 HR (600x 400 dpi) con leggio-libro motorizzato (per libri, disegni, mappe, fogli d’erbario)

Pubblicazioni

• Maggiore et al., 2019. Science Collections produced by marine environmental research: from sample to the Web. Vie et Milieu 69(1): 61-70. ISSN: 0240-8759. https://wwwphp.obs-banyuls.fr/Viemilieu/index.php/volume-69-2019/69-issue-1/691-article-7.html
• Tagliapietra et al., 2021. After a century in the Mediterranean the warm-water shipworm Teredo bartschi invades the Lagoon of Venice (Italy) overwintering a few degrees above zero. Biological Invasion 23: 1595-1618 https://doi.org/10.1007/s10530-021-02461-3
• Fabbrocini et al., 2021. Development of alternative and sustainable methodologies in laboratory research on sea urchin gametes. Marine Environmental Research, art. n. 105282. https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2021.105282
• Capotondi et al., 2022. The test wall of ?Nubeculina Cushman 1924 (Miliolida): updates on its agglutinated-porcelaneous wall structure from entire and sectioned specimens. Micropaleontology, vol 68, n.6: 557-567. DOI: 10.47894/mpal.68.6.02

Progetti recenti

• Convenzione tra Istituto Superiore per la Protezione e la Ricerca Ambientale (ISPRA), Regione Campania e CNR-ISMAR per la realizzazione e informatizzazione del foglio geologico alla scala 1:50.000 n.416 “Sessa Aurunca” per il completamento della Carta Geologica ufficiale d’Italia – Progetto CARG) https://www.cnr.it/it/progetti-di-ricerca/progetto/46177/na-conv-ispra-reg-camp-sessa-aurunca-dta-ad002-679. 2021 – in corso.
• PNRR ITINERIS – Italian Integrated Environmental Research Infrastructures System. https://itineris.cnr.it. Attività dal 2022 in corso.
• La Rete Italiana di Ricerca Ecologica di Lungo Termine (LTER – Italia) e Infrastruttura di Ricerca ESFRI eLTER-RI. https://elter-ri-eu; http://www.lteritalia.it. 2006 – in corso.
• Source-to-sink: effetti della fusione del permafrost sull’oceano artico-JRC ENI_CNR. https://www.cnr.it/it/progetti-di-ricerca/progetto/34220/source-to-sink-effetti-della-fusione-del-permafrost-sull-oceano-artico-jrc-eni-cnr-t-tesi-dta-ad001-286. 2019 – in corso.

Referenti

Stefano Aliani, Fabrizio Bernardi Aubry, Simona Armeli Minicante, Lucilla Capotondi, Lorenzo Consorti, Laura Giordano, Irene Guarneri, Giuseppe Suaria